Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms