Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Susd3Q9D176 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Susd3Q9D176 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Susd3Q9D176 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Susd3Q9D176 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Susd3Q9D176 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Susd3Q9D176 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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