Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stx17Q9D0I4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stx17Q9D0I4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx17Q9D0I4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms