Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ndc80Q9D0F1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ndc80Q9D0F1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ndc80Q9D0F1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndc80Q9D0F1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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