Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms