Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms