Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sgo1Q9CXH7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sgo1Q9CXH7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sgo1Q9CXH7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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