Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Xrcc3Q9CXE6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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