Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms