Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms