Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms