Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms