Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sppl3Q9CUS9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms