Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms