Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms