Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms