Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl11Q9CQF0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms