Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms