Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sar1bQ9CQC9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sar1bQ9CQC9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms