Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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