Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Commd4Q9CQ02 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms