Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2a1Q99PM3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms