Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms