Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cep41Q99NF3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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