Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms