Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms