Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms