Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a9Q99MR3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms