Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms