Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms