Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlcd1Q99JT6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms