Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcd2Q99JR8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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