Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc30a1Q99J38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc30a1Q99J38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc30a1Q99J38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc30a1Q99J38 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ttc30a1Q99J38 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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