Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn16Q925N4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms