Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms