Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms