Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf3Q922U1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms