Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms