Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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