Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Afg3l1Q920A7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Afg3l1Q920A7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Afg3l1Q920A7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms