Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek8Q91ZR4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek8Q91ZR4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek8Q91ZR4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek8Q91ZR4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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