Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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