Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms