Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgdsQ8VDR7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms