Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1Q8VDF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Uhrf1Q8VDF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Uhrf1Q8VDF2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Uhrf1Q8VDF2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Uhrf1Q8VDF2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Uhrf1Q8VDF2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1Q8VDF2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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