Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms