Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Slc6a20aQ8VDB9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Slc6a20aQ8VDB9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Slc6a20aQ8VDB9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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