Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dnajc28Q8VCE1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Dnajc28Q8VCE1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Dnajc28Q8VCE1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Dnajc28Q8VCE1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Dnajc28Q8VCE1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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