Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BbxQ8VBW5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms