Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim29Q8R2Q0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms